Colca Canyon je domovem kondora andského, kolibříků, hus, králíků, lišek, atd. V blízkosti vesnice Chivay – největšího osídlení Colca Canyonu, najdete přírodní horké prameny La Calera. Oblíbenou turistickou zastávkou je Cruz del Condor – vyhlídka, kde se pozorují kroužící kondoři, využívající termiky stoupající kaňonem.