Obec byla založena španělskými průzkumníky jako „Santa María de los Valles de Chiclayo“ v 16. století. Jako město bylo vyhlášeno v roce 1835 a město získalo název Chiclayo. Město bylo založeno nedaleko pravěkého archeologického areálu s ruinami Wari.
Chiclayo je jednou z nejdůležitějších oblastí v Peru. Za návštěvu stojí katedrála Chiclayo, Městský palác či bazilika San Antonio. V blízkosti města najdete archeologická naleziště kultury Močiků (100- 700 n.l.) a Lambayecké kultury (nebo Sicán) 700-1350 n.l. Nejvýznamnějším nálezem je hrobka Pána ze Sipánu (kultura Močiků).